Eduardo Batarda começou por estudar Medicina na Faculdade de Medicina da Universidade de Coimbra, mas enveredou pela pintura, tendo-se Licenciado na Escola Superior de Belas-Artes de Lisboa (hoje FBAUL), em 1968.
Bolseiro da Fundação Calouste Gulbenkian, assim obteve uma pós-graduação pelo Royal College of Art, em Londres, onde viveu entre 1971 e 1974. Obteve o diploma de MaRCA e foi distinguido com os Prémios Sir Alan Lane e John Minton.
Foi Professor da Escola Superior de Belas-Artes do Porto. Está representado no Centro de Arte Moderna da Fundação Calouste Gulbenkian e nas coleções do Museu do Chiado, bem como em coleções privadas na Europa, Reino Unido e Estados Unidos da América.
Foi-lhe atribuído, em 2005, o grau de Comendador da Ordem do Infante D. Henrique e, em 2007, o Grande Prémio EDP. Em 2020 foi agraciado pelo governo português com a Medalha de Mérito Cultural.